Što je GENOME-WIDE neinvazivni prenatalni test (NIPT)?
„Genome-wide neinvazivni prenatalni test NATIVA omogućava ne samo otkrivanje najčešćih kromosomskih aneuploidija, već i otkrivanje rijetkih autosomalnih aneuploidija (RAA), kao i klinički značajnih parcijalnih delecija i duplikacija (CNV) veličine ≥7 Mb. Većina ovih trisomija nije kompatibilna sa životom i dovodi do gubitka trudnoće. Međutim, u mozaičnom obliku mogu opstati i rezultirati prirođenim malformacijama, intelektualnim poteškoćama, zastojem u rastu i razvoju, nepovoljnim ishodom trudnoće, kao i fetalnom uniparentalnom disomijom.”
– prof. Yuval Yaron,
Direktor Jedinice za prenatalnu genetsku dijagnostiku, Medicinski centar Sourasky, Tel Aviv.
Do sada moguće jedino kariotipizacijom, ova metoda omogućuje otkrivanje patogenih varijanti broja kopija (CNV). Iako se mnoge manje CNV varijante u konačnici mogu klasificirati kao varijante nepoznatog značaja, gotovo svi CNV-ovi veličine ≥7 Mb bit će klasificirani kao patogeni, čak i kod fetusa bez vidljivih malformacija.
Jesu li autosomalne trisomije rijetke?
Uz genome-wide NATIVA NEXT, rijetke autosomalne trisomije su značajne i nisu tako rijetke.
Nativa prenatalni test
Illumina sekvencioniranje cjelokupnog genoma
Drugi prenatalni testovi
Tehnologija targetiranog sekvencioniranja genoma
Zahvaljujući svjetskom lideru u sekvencioniranju, Illumina je uz pomoć licencirane tehnologije omogućila najveći napredak u prenatalnom testiranju, pružajući visoko osjetljive i specifične informacije o zdravlju kromosoma bebe – bez rizika povezanih s invazivnim postupcima poput amniocenteze ili biopsije horionskih resica (CVS).
Test je validiran za izvođenje već od 10. tjedna trudnoće te je pokazao vrhunske rezultate u pogledu osjetljivosti i specifičnosti za većinu najčešćih trisomija.
Prednost -Stroži i optimizirani pristup sekvencioniranju
NATIVA neinvazivni prenatalni test (NIPT) koristi snagu masovnog paralelnog sekvencioniranja (MPS) duž cijelog genoma. Najdublji pristup sekvencioniranju u industriji, u kombinaciji s visoko optimiziranim algoritmom pruža jasniji i pouzdaniji rezultat nego druge metode (SNP, ARRAY, targetirano sekvencioniranje).
Nauka dubljeg sekvencioniranja
Sekvencioniranje na nižoj razini zahtijeva procjenu fetalne frakcije (ff) kao kompenzaciju za slabiju snagu sekvencioniranja. Bez procjene fetalne frakcije, stopa lažno negativnih rezultata bila bi klinički neprihvatljiva, što bi dovelo do većeg broja odbacivanja uzoraka i kašnjenja u dolasku rezultata.
NATIVA test ima najniži postotak neuspjelih analiza (manje od 0,1%) jer ne ovisi o postotku fetalne DNK.
Zašto je to važno?
Fetalna frakcija nije samostalni indikator rizika za aneuploidije i ne koristi se kao jedina mjera kvalitete uzorka.
U usporedbi s ostalim tehnologijama prenatalnog probira, NATIVA je zahvaljujući inovativnim metodama i algoritmima jedini test u Europi baziran na CE-IVD certificiranoj NGS tehnologiji u svakoj fazi analize.
Sekvencioniranjem cijelog genoma bebe, NATIVA može dati pouzdan rezultat čak i kada je fetalna frakcija niža od 4%.
PERFORMANSE TESTA
MOĆ NATIVA TESTA
Jasan i precizan rezultat
Mogući rezultati testiranja za autosomske kromosome su: aneuploidije nisu detektirane, aneuploidije su detektirane.
Rezultati analize spolnih kromosoma mogu biti: aneuploidije nisu detektirane, aneuploidije su detektirane.
Opcije rezultata za mikrodelecije su: mikrodelecije nisu detektirane, mikrodelecije su detektirane.
Preporuke i mišljenja medicinskih udruga
Američki koledž ginekologa i obstretičara preporučuje da se svim ženama, bez obzira na dob, preporuči prenatalno otkrivanje aneuploidija, putem skrining metoda ili invazivne dijagnostike. Uvođenjem NIPT-a, medicinske udruge su podržale primjenu kod žena sa visokim rizikom za prisustvo aneuplodija kod bebe.
Žene koje se smatraju u kategoriji visokog rizika imaju jednu ili više indikacija: 35 godina i više, ultrazvučni nalazi koji ukazuju na povećan rizik od aneuploidije, povijest prethodnih trudnoća s trisomijama, pozitivan dabl i tripl test, balansirana Robertsonova translokacija s povećanim rizikom za trisomiju 13 ili 21.
Također, prateći publikacije koje opisuju performanse NIPT testa kod populacije niskog ili bez rizika, medicinska udruženja podržavaju NIPT za analizu fetalnih aneuploidija kod svih trudnica.
Američki koledž ginekologa i obstetričara (ACOG) i Društvo za fetalnu medicine (SMFM)
Skrining testovi za aneuploidije sada su dostupni svim trudnicama u svim trimestrima trudnoće. Među njima su testovi prvog trimestra, triple, quad i penta skrining testovi, NIPT te ultrazvučni skrining kao poseban skrining test.
Međunarodno društvo za prenatalnu dijagnostiku (ISPD)
Trenutno se smatraju prikladnim sljedeće opcije protokola: skrining slobodne cirkulirajuće fetalne DNK (NIPT) kao primarni test namijenjen svim trudnicama.
Američki koledž Medicinske Genetike i Genomike (ACMG)
Neinvazivni prenatalni skrining pomoću slobodne cirkulirajuće fetalne DNK (cell free DNA) brzo se integrirao u prenatalnu skrb nakon inicijalne izjave Američkog koledža medicinske genetike i genomike (ACMG) iz 2013. godine. Novi dokazi snažno upućuju na to da NIPS može zamijeniti tradicionalni skrining za Down, Edwards i Patau sindrom kroz cijeli raspon dobi majke, uz primjenu od 9. do 10. tjedna trudnoće.
FAQ pitanja
Da li senzitivnost i specifičnost testa variraju u zavisnosti od toga u kojoj je sedmice trudnoće urađen test?
Senzitivnost i specifičnost NATIVA testa ne variraju značajno ovisno o tjednu trudnoće u kojem je test obavljen. To je zato što NATIVA test ne ovisi o postotku fetalne frakcije DNK u uzorku krvi, što je često faktor koji kod drugih testova može utjecati na točnost rezultata, naročito u ranoj trudnoći.
Dakle, NATIVA test daje pouzdane rezultate već od 10. tjedna trudnoće, bez smanjenja osjetljivosti ili specifičnosti uslijed ranijeg izvođenja testa.
Hoće li prethodna trudnoća s aneuploidijom utjecati na rezultate NIPT testa u sljedećoj trudnoći?
Ne. Slobodno cirkulirajuća DNK nestaje iz krvotoka majke nekoliko sati nakon poroda (prekida trudnoće). Stoga slobodno cirkulirajuća DNK iz prethodne trudnoće, bez obzira je li beba imala aneuploidiju ili ne, neće utjecati na rezultat NIPT testa u sljedećoj trudnoći.
Može li se test raditi kod blizanačke trudnoće?
Da, test se radi i za blizanačku trudnoću od 10. tjedna trudnoće.
Može li se NATIVA test raditi kod trudnoća nastalih potpomognutom oplodnjom (vantjelesna oplodnja), uključujući doniranje jajne stanice?
Da, NIPT koji koristi tehnologiju sekvencioniranja cijelog genoma (NATIVA test) ne ovisi o sličnostima ili razlikama između fetalne i majčine DNK te se može koristiti kod trudnoća nastalih vantjelesnom oplodnjom, uključujući i doniranje jajne stanice.
Kada se test može najranije obaviti tijekom trudnoće?
Test se može obaviti već od 10. tjedna trudnoće.
Za koliko dana se dobivaju rezultati testa?
Rezultati testa se dobivaju za 5 do 7 radnih dana od datuma prijema uzorka u laboratorij.
Kolika je stopa neuspjelih testova?
NATIVA test ima najmanju stopu neuspjelih testova u usporedbi s ostalim NIPT testovima (0,1%).
Što učiniti ako je test Vaše pacijentice pozitivan?
Iako NATIVA test pokazuje visoku preciznost u otkrivanju trisomija 21, 18, 13 i nisku stopu lažno pozitivnih rezultata, svaki pozitivan nalaz NIPT testa treba potvrditi invazivnim dijagnostičkim postupkom poput amniocenteze ili biopsije horionskih resica..
Je li potrebna informirana suglasnost za izvođenje testa?
Da. Nakon detaljnog informiranja, trudnica donosi odluku želi li napraviti test i koji. Potrebno je potpisati informiranu suglasnost u kojoj su navedene sve informacije o testu, analizi, preciznosti i ograničenjima.
Koja su ograničenja NATIVA testa?
NATIVA test nije dijagnostički test za utvrđivanje svih mogućih zdravstvenih problema fetusa ili svih promjena na kromosomima. Ne može otkriti fizičke anomalije ili genetske bolesti. Rezultat „Aneuploidije nisu detektirane“ ne jamči apsolutno zdravlje fetusa.
Što može utjecati na rezultate NATIVA testa?
NATIVA prenatalni test analizira potpune kromosomske aneuploidije. Postoji mala vjerojatnost da rezultati ne odražavaju kromosome fetusa, nego promjene u placenti (tzv. izolirani mozaicizam posteljice) ili kod majke (tzv. kromosomski mozaicizam majke). Također postoji mala mogućnost lažno pozitivnih ili lažno negativnih rezultata.